CONSIDERANDO QUE: você já esteja logado no cPanel.
Caso prefira enviar seus arquivos pelo próprio painel, sem a necessidade de um programa próprio para FTP, entre no painel e siga os passos a baixo.
- Vá em 'Gerenciador de Arquivos' (na seção arquivos)
- Clique em 'Fazer Upload' (nos ícones superiores)
- E pra finalizar selecione o arquivo a ser enviado e volte para o painel em seguida
(Em casos de arquivos .zip, ao voltar para o painel, selecione o arquivo e nos ícones superiores clique em extrair)
Simples assim!